Фонд "Столичная Экология" принимает активное участие во многих экологических проектах и сам является инициатором многих программ. Ратует за продвижение тех проектов, которые способны изменить экологию Московского региона в лучшую сторону.
Сотрудники фонда, входящие в состав различных общественных групп, на правах гражданского контроля ведут наблюдение за самым разными деятельностями на территории Москвы и области. Сюда входят и разного рода строительства вблизи зелёных и охраняемых территорий, городское благоустройство, озеленение территорий и т.п.
О выявляемых нарушениях фонд "Столичная Экология" немедленно сообщается в ответственные органы, проводятся проверки и расследования.